珍珠的各种颜色，都是归功于孕育它的母贝的品种，珍珠贝越厚，珍珠颜色就越丰富，并且彩虹色更多，薄珍珠贝就更倾向于产生色调少的奶油色珍珠，所以存在不同颜色的珍珠。
牡蛎能生产出几乎各种颜色的珍珠。我们提到珍珠颜色时，特指体色，即珍珠的潜在基色。标准的颜色从黑色塔希提珠，到奶白色的阿古屋珠，到银白色的南海珠。但如果仔细检查上述任何一种珍珠，你会发现其它颜色，即在珍珠表面上反射的折光色。
塔希提黑珍珠具有从柔和银灰色到深乌黑色的色调，在这些颜色范围内你会发现粉红、紫色甚至绿色的折光色。
珍珠的折光色常常稍带粉红、银色或兰色。黑珍珠的折光色大多数为绿色或粉红色。珍珠颜色常常用体色和折光色的组合来描述。例如，白玫瑰色说明带玫瑰折光色的白珍珠。
杂色珍珠（非白色的珍珠，例如黑珍珠）的评价还有第三个标准：色调。珍珠的色调说明杂色珍珠的明暗度并按浅至深的尺度分级。
对珍珠颜色和色调的喜好，各人各地不同。带有玫瑰折光色的粉红色和白色珍珠在美国和日本很流行。在法国，人们喜爱奶白色。在南美和西班牙，人们渴望黄色和金色的。肤色与这种喜好很有关系。
一种颜色并不比其它颜色高贵，但某种颜色的需求和稀缺性影响了它们的价格。即使这样，颜色只占珍珠价值的10%。玫瑰红色的珍珠需求一直很大，因此，它们经常比奶白色或金色的珍珠要贵。南海黑珍珠常常价格很高，它们要比传统的粉红色阿古屋珍珠卖价要高。
珍珠的颜色很多：有白、金、银、粉、红、黑、蓝、灰等颜色，其中以白色稍带玫瑰红色为最佳，以蓝黑色带金属光泽为特佳，但若见到明显的黑色、灰色珍珠，就应引起警惕，有可能是染色珠。区别染色、真色珍珠的方法是：天然黑珍珠并非纯黑色，而是略带彩虹样闪光的深蓝黑色，或带有青铜色调的黑色；染色珍珠呈灰黑色和黑色，颜色单调、光泽差，若用布蘸少许5％左右的稀硝酸擦洗珍珠，则布上会留有黑迹。
消费者在购买贵重的黑色珍珠时，要分外留意珍珠是由薄层的文石矿物日久天长层叠而成的，普通光线入射透过这些薄层文石时，会发生反射及干涉等光学现象，因而珍珠表面会闪耀出美丽的珍珠光泽，使人爱不释手，这就是珍珠成为名贵装饰品的主要原因。
